Lékárník Caleb Bradham z Durhamu v Severní Karolíně uvařil svou první várku Pepsi Coly, tehdy pojmenované jednoduše „Bradův drink“, před 130 lety. V roce 1893 vytvořil tento nápoj jako alternativu k populárnímu nápoji Coca-Cola a prodával ji ve své lékárně. Nápoj měl úspěch a přesně před 120 lety, dne 16. června 1903, založil firmu Peps-Cola a začal prodávat svůj nápoj ve státu Severní Karolína. Následně ho distribuoval po celých Spojených státech.
Název Pepsi-Cola je odvozen od řeckého slova "pepsis", což znamená trávení, a slova "kola", které odkazuje na jednu z ingrediencí nápoje, kolové ořechy. V roce 1992 byla v USA uvedena na trh čirá, bezbarvá verze nápoje s názvem Pepsi Crystal. Tento nápoj však nebyl příliš úspěšný a byl brzy stažen z trhu. V témže roce společnost Pepsi-Cola uzavřela partnerskou dohodu s americkou fotbalovou ligou NFL a stala se oficiálním sponzorem Super Bowlu.
Dnes je Pepsi jedním z největších výrobců nealkoholických nápojů na světě. Nikdy však svého rivala nepřekonala.