Obvinění, Chálid Šajch Muhammad, Valíd Attaš a Mustafa Ahmad Havsáví, jsou momentálně drženi ve věznici Guantánamo na Kubě. Pentagon potvrdil uzavření dohod o přiznání viny s těmito vězni, avšak detaily neupřesnil. Dohody pravděpodobně zahrnovaly zrušení trestu smrti výměnou za přiznání viny.
Americký ministr obrany Lloyd Austin zbavil Susan Escallier pravomoci uzavírat tyto dohody a převzal odpovědnost sám. „S okamžitou platností odstupuji od tří předsoudních dohod...,“ uvedl. Muhammad, považovaný za strůjce útoků, údajně pomohl vycvičit a řídit únosce. Při útocích 11. září 2001 zemřelo téměř tři tisíce lidí. Islamisté unesli čtyři letadla, z nichž dvě narazila do mrakodrapů Světového obchodního centra, jedno do Pentagonu a čtvrté se zřítilo v Pensylvánii.
K útokům se přihlásil Usáma bin Ládin, šéf al-Káidy. Americká invaze do Afghánistánu vedla k pádu Talibanu, který bin Ládina chránil. Bin Ládin byl zabit americkými silami v roce 2011 v Pákistánu. Válka v Afghánistánu skončila v roce 2021 stažením amerických sil a znovuobsazením země Talibanem.
Věznici Guantánamo, zřízenou po útocích 11. září, americká administrativa využívala k zadržování podezřelých z terorismu. Většina z 780 zadržovaných osob však nebyla nikdy obviněna a byli vystaveni mučení. Dnes je v Guantánamu zadržováno asi 30 vězňů. Prezident Joe Biden plánuje věznici zavřít před koncem svého funkčního období.
