Více než půl miliardy korun vynaložilo Ministerstvo školství, mládeže a tělovýchovy v letech 2016 až 2023 na projekty, které měly vést ke zvýšení kvality vzdělávání v regionálním školství a ke zlepšení výsledků žáků základních a středních škol. Kontrola Nejvyššího kontrolního úřadu ukázala, že peníze použilo neúčelně.
Projekty na řízení vzdělávání byly splněné formálně – k praktickému využití téměř nevedly. Příkladem může být Průvodce strategickým a akčním plánováním. Jeho součástí byla videa, jenže to nejsledovanější mělo jen 537 zhlédnutí. Přitom škol je v Česku asi 11 tisíc. Nízká sledovanost dokládá, že projekt nepřispěl ke zlepšení kvality vzdělávání ve školách a peníze se utratily zbytečně.
Ve veřejné zakázce na Informační systém vzdělávání za 27,4 milionu korun porušilo ministerstvo zákon o zadávání veřejných zakázek. Uzavřelo totiž dodatek ke smlouvě, kterým porušilo zákaz podstatné změny ve veřejné zakázce. Na základě dodatku uhradilo dodavateli 1,3 milionu za detailní návrh implementace rozšiřující funkcionality informačního systému, aniž by ho využilo.
Ministerstvo také nevyhodnocovalo dlouhodobé záměry vzdělávání.