Počet pohlavně dospělých jedinců schopných se spářit se za posledních několik let výrazně snížil. Ve vodách severovýchodního Atlantiku tedy blíže k evropským zemím jako je Norsko nebo Velká Británie se její populace snížila průměrně o 23 procent. V severozápadním Atlantiku je situace ještě mnohem horší. U pobřeží USA a Kanady počty dospělých makrel klesly o téměř 90 procent.
Největším problém je, že pro její chutné a poměrně levné maso často rybáři nedodržují stanovené kvóty pro rybolov. Pokud to takto půjde dál, může se z makrely obecné stát kriticky ohrožený druh a nakonec z vymizí úplně. Její maso mohou lidé na svém stole vyměnit za stejně chutného sledě obecného, jehož populaci rybolov nijak nesnížil.
