Po zářijových povodních se pracovníci hygienických stanic a České inspekce životního prostředí (ČIŽP) zaměřují na obnovu a bezpečnost v zasažených oblastech. Pravidelně monitorují stav řek, dočasných skládek odpadu a zasažené průmyslové areály. Podle ministra zdravotnictví Vlastimila Válka se díky rychlé distribuci informací a efektivní spolupráci s neziskovými organizacemi a samosprávami podařilo minimalizovat zdravotní rizika.
ČIŽP intenzivně sleduje Ostravsko, Opavsko a Jesenicko, kde poškozené čistírny a provizorní skládky zajišťují drony. V Ostravě je navíc klíčová obnova centrální čistírny, která se předpokládá v únoru. Ministerstvo životního prostředí mezitím schválilo finanční podporu pro 23 obcí, které prostředky okamžitě rozdělují potřebným domácnostem. Obce, jejichž infrastruktura byla povodní vážně poškozena, si mohou žádat o dotace ve výši přes miliardu korun.
Voda na zasažených místech podléhá důkladným rozborům a obyvatele v rizikových oblastech úřady varují, aby dbali na hygienu, používali ochranné pomůcky při úklidu a konzumovali jen bezpečnou vodu.