Podle ministerstva má sjednocení přinést lepší řízení, silnější odborné zázemí a rychlejší reakce při mimořádných událostech. Krajské hygienické stanice by dál působily v regionech, účastnily se krizového řízení a vykonávaly kontrolní činnost, nově ale v jednotné organizační struktuře. Ministerstvo tím chce odstranit současnou roztříštěnost systému a přiblížit se modelům v řadě vyspělých zemí.
S přípravou reformy už ministerstvo začalo. Odborná pracovní skupina má do léta předložit konkrétní návrh nové struktury systému. Následovat mají legislativní změny, bez nichž se zásadní přestavba neobejde. Vedení resortu počítá s tím, že proces potrvá několik let a změny se neprojeví okamžitě.
Záměr má překvapivě širokou politickou podporu. Souhlas s centralizací vyjádřili nejen koaliční partneři, ale i opoziční strany, které dlouhodobě upozorňují na slabiny současného modelu. Podle nich by jednotné řízení mohlo omezit vliv regionálních sporů a posílit odborné rozhodování. Někteří bývalí ministři připomínají, že podobný návrh už v minulosti vznikl, ale tehdy narazil na politický odpor.
Pokud se reformu podaří prosadit, půjde o jednu z největších změn v oblasti veřejného zdraví za poslední desetiletí. Ministerstvo ji označuje za klíčovou prioritu současného volebního období.